Como centro médico académico, Stony Brook Children's tiene el privilegio de capacitar a la próxima generación de médicos, algo que también brinda muchos beneficios a los pacientes del hospital, incluido el acceso a los últimos protocolos y procedimientos, así como a algunas de las mejores mentes de la medicina.
La residencia de oftalmología de Stony Brook es un programa de formación totalmente acreditado. Los residentes de oftalmología dedican parte de su tiempo a trabajar en el servicio de oftalmología pediátrica durante sus rotaciones clínico-quirúrgicas. El Dr. Reynolds y el Dr. Movaghar también participan activamente en la educación de estudiantes de medicina, residentes y becarios del Centro Médico de la Universidad de Stony Brook a través de conferencias y seminarios, así como rotaciones clínicas. El Departamento de Oftalmología ofrece regularmente Grandes Rondas a las que asisten muchos oftalmólogos de la comunidad y del condado de Suffolk.